Wacholder wird von verschiedenen Nadelbräunepilzen befallen. Man kann die betroffenen Stellen bis ins gesunde Holz zurückschneiden. Das hat aber den Nachteil, dass die Hecke durchsichtiger wird. Die so entstandenen Löcher wachsen nur langsam wieder zu. Sind zu viele Stellen befallen, sollte man in Betracht ziehen, die ganze Hecke durch eine einheimische Pflanzenart zu ersetzen. Unter den Nadelhölzern kommen etwa Eibe und Fichte in Frage, als Laubholzart unter anderem Hainbuche und Kornelkirsche.

Wichtig ist, dass die Pflanzen genug Platz haben. Hecken sollten nicht in einen zu schmalen Streifen gepflanzt werden, zum Beispiel zwischen den Steinplatten des Sitzplatzes und einem Trottoir